Software Engineer – Bioinformatics Pipelines

Emploi pas sur LinkedIn

🕒 il y a 19 jours

🌽 Illinois – Distant

🌽 Illinois – Remote

💵 $100 - $115 / heure

⏳ Contrat

🟡 Intermédiaire

🟠 Senior

🧑‍💻 Développeur Full-Stack

👻 Score fantôme 20%

Ce que ça veut dire : la probabilité que cette offre reste ouverte sans recrutement actif.Comment le lire : 60 % ou plus, on pense que c'est une offre fantôme. Un score plus bas est moins inquiétant.Comment on la calcule : ancienneté, republications, postes ouverts vs taille de l'équipe, rapidité de clôture, et si le salaire est indiqué.À noter : une estimation à partir de données publiques, pas un jugement sur l'entreprise. De vraies offres peuvent avoir un score élevé, alors prenez-le comme un indice, pas comme un fait.

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Ontrac Solutions

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11 - 50 employés

Fondée en 2010

🤖 Intelligence artificielle

💼 Conseil

🤝 B2B

Artificial Intelligence • Consulting • B2B

Ontrac Solutions est une entreprise de services technologiques axée sur l'IA, aidant les organisations à concevoir, mettre en œuvre et étendre des systèmes pilotés par l'IA, des architectures cloud et des intégrations de plateformes d'entreprise. Elle offre des stratégies d'IA et la mise en œuvre d'IA générative (y compris RAG et recherche intelligente), la migration et l'optimisation cloud (architecture multi-cloud, Kubernetes, Terraform, GitOps et FinOps), l'ingénierie des données et de l'intégration, le développement de plateformes CRM/CMS/e-commerce, et un renforcement des talents techniques intégrés / augmentation du personnel pour faire passer l'IA de l'expérimentation à la production. Avec des pôles d'innovation à Chicago et Karachi, Ontrac se concentre sur la livraison de solutions IA et cloud prêtes pour la production qui engendrent des résultats commerciaux mesurables.

Description

• Maintain and improve the software quality of genomics pipelines running in the customer's on-premise HPC environment • Tune pipeline performance in the HPC environment • Automate pipeline operations and recurring engineering tasks • Provide operational support, troubleshoot failures, and resolve issues in the movement and delivery of genomic data • Implement and maintain integrations between pipelines, laboratory systems, and sequencing instruments • Implement and maintain technical infrastructure enabling the movement, analysis, and delivery of genomic data alongside the customer's bioinformatics team • Support additional pipeline workload arising from the LIS transition from Soft to Epic Beaker • Participate as a full member of an agile pipeline team throughout the engagement • Collaborate with the delivery team and customer stakeholders from initial definition through final delivery

🎯 Exigences

• Professional software engineering experience with a demonstrated background in bioinformatics pipeline engineering • Hands-on production experience with Python, Bash, and Nextflow • Strong software engineering fundamentals applied to bioinformatics pipelines, with a focus on software quality, performance tuning, automation, and operational support • Proficiency in Python and Bash • Experience with Nextflow for workflow management • Experience developing, tuning, and operating pipelines in an on-premise high-performance computing (HPC) environment • Experience integrating software with laboratory systems and sequencing instruments • Experience working as a member of an agile team • Ability to integrate into an established team quickly and contribute with limited ramp-up • Direct experience with Illumina, Oxford Nanopore, or PacBio sequencing platforms (useful qualification)