Software Engineer – Bioinformatics Pipelines

Stelle nicht auf LinkedIn

🕒 vor 19 Tagen

🌽 Illinois – Remote

🌽 Illinois – Remote

💵 $100 - $115 / Stunde

⏳ Vertrag

🟡 Mittelstufe

🟠 Senior

🧑‍💻 Full-Stack-Entwickler

👻 Geisterscore 20%

Was es bedeutet: wie wahrscheinlich diese Stelle offen bleibt, ohne dass aktiv eingestellt wird.So liest du es: 60 % oder höher heißt, wir halten das für einen Geisterjob. Niedrigere Werte sind weniger bedenklich.Wie wir werten: Dauer offen, Neuveröffentlichungen, offene Stellen vs Teamgröße, wie schnell Stellen geschlossen werden, und ob ein Gehalt angegeben ist.Hinweis: eine Schätzung aus öffentlichen Daten, kein Urteil über das Unternehmen. Echte Stellen können hoch punkten, nutze es also als Hinweis, nicht als Fakt.

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Ontrac Solutions

WebsiteLinkedInAlle Stellen

11 - 50 Mitarbeiter

Gegründet 2010

🤖 Künstliche Intelligenz

💼 Beratung

🤝 B2B

Artificial Intelligence • Consulting • B2B

Ontrac Solutions ist ein technologieorientiertes Dienstleistungsunternehmen mit einem KI-Schwerpunkt, das Organisationen bei der Entwicklung, Implementierung und Skalierung von KI-gesteuerten Systemen, Cloud-Architekturen und Unternehmensplattform-Integrationen unterstützt. Das Unternehmen bietet KI-Strategien und generative KI-Implementierungen (einschließlich RAG und intelligenter Suche), Cloud-Migration und -Optimierung (Multi-Cloud-Architektur, Kubernetes, Terraform, GitOps und FinOps), Daten- und Integrationsengineering, Entwicklung von CRM/CMS/E-Commerce-Plattformen und die Bereitstellung von technischem Fachpersonal zur Unterstützung bei der Transformation von KI-Experimenten in produktive Anwendungen. Mit Innovationszentren in Chicago und Karachi konzentriert sich Ontrac darauf, produktionsreife KI- und Cloud-Lösungen zu liefern, die messbare Geschäftsergebnisse erzielen.

Beschreibung

• Maintain and improve the software quality of genomics pipelines running in the customer's on-premise HPC environment • Tune pipeline performance in the HPC environment • Automate pipeline operations and recurring engineering tasks • Provide operational support, troubleshoot failures, and resolve issues in the movement and delivery of genomic data • Implement and maintain integrations between pipelines, laboratory systems, and sequencing instruments • Implement and maintain technical infrastructure enabling the movement, analysis, and delivery of genomic data alongside the customer's bioinformatics team • Support additional pipeline workload arising from the LIS transition from Soft to Epic Beaker • Participate as a full member of an agile pipeline team throughout the engagement • Collaborate with the delivery team and customer stakeholders from initial definition through final delivery

🎯 Anforderungen

• Professional software engineering experience with a demonstrated background in bioinformatics pipeline engineering • Hands-on production experience with Python, Bash, and Nextflow • Strong software engineering fundamentals applied to bioinformatics pipelines, with a focus on software quality, performance tuning, automation, and operational support • Proficiency in Python and Bash • Experience with Nextflow for workflow management • Experience developing, tuning, and operating pipelines in an on-premise high-performance computing (HPC) environment • Experience integrating software with laboratory systems and sequencing instruments • Experience working as a member of an agile team • Ability to integrate into an established team quickly and contribute with limited ramp-up • Direct experience with Illumina, Oxford Nanopore, or PacBio sequencing platforms (useful qualification)