Senior Software Engineer, Genomics

🕒 il y a 2 jours

🇺🇸 États-Unis – Télétravail

💵 $180 000 - $200 000 / an

⏰ Temps Plein

🟠 Senior

🧑‍💻 Développeur Full-Stack

👻 Score fantôme 7%

Ce que ça veut dire : la probabilité que personne ne recrute vraiment pour cette offre.Comment le lire : 60 % ou plus, on pense que c'est une offre fantôme. Un score plus bas est moins inquiétant.Comment on la calcule : ancienneté, republications, postes ouverts vs taille de l'équipe, rapidité de clôture, et si le salaire est indiqué.À noter : une estimation à partir de données publiques, pas un jugement sur l'entreprise. De vraies offres peuvent avoir un score élevé, alors prenez-le comme un indice, pas comme un fait.

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Feanix

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11 - 50 employés

Fondée en 2024

🌾 Agriculture

🧬 Biotechnologie

🤖 Intelligence artificielle

Agriculture • Biotechnology • Artificial Intelligence

Feanix est une entreprise biotechnologique et logicielle axée sur les exploitations laitières qui automatise les décisions génétiques et de gestion des troupeaux. Son produit Autopilot combine le séquençage complet du génome, les données de gestion des troupeaux (DairyComp, archives laitières, alimentation, santé, moniteurs d'activité) et l'économie spécifique des exploitations pour créer un moteur de prédiction basé sur le machine learning qui évalue chaque vache selon l'économie réelle de la ferme. Autopilot convertit des billions de points de données en recommandations classées et exploitables (reproduction, viande bovine, DNB, vente, réforme, liste de surveillance) qui s'intègrent dans les systèmes existants de la ferme et priorisent le profit au lieu de classements génétiques génériques. La plateforme est conçue pour réduire les remplacements de faible valeur, améliorer l'allocation de semence, maintenir les objectifs de taille de troupeau et accélérer le gain économique pour les exploitations.

Description

• Build and operate Feanix’s production genomics pipeline from sample through sequencing, alignment, imputation, genotyping, and parentage/trait results • Automate pipeline scheduling and triggering with retries, version pinning, alerting, CI, monitoring, and reproducible workflows • Lead development of an authoritative sample-state ledger tracking each sample’s processing status and failure reason • Move parentage fleet runs onto scheduled execution with completion and lateness alerts • Partner with infrastructure engineering to bring genomics repositories onto CI and deployment systems • Manage sequencing compute and storage costs, including lifecycle policies for hundreds of terabytes • Own lab and vendor data intake from in-house sequencing, external labs, and genotyping-chip providers • Make breeding-value model training runnable and repeatable • Establish engineering standards for genomics as the team grows • Collaborate with the founding genomics engineer, scientists, infrastructure engineers, and other engineers • Participate in weekly on-call and triage rotation • Travel 15–20%, including commercial dairy visits and headquarters visits

🎯 Exigences

• Several years running scientific or bioinformatics pipelines in production, including scheduled, monitored pipelines depended on by others • Fluency in genomic data formats and tools: FASTQ/BAM/VCF, PLINK, imputation (GLIMPSE, Beagle, or similar), coverage and QC metrics • Experience building sample tracking, LIMS-like state, or similar item-state systems • Strong Python • Comfort with S3-scale data, idempotent pipelines, retries, and alerting • Cost awareness with large data, including storage lifecycle and compute spend per unit • Experience working alongside scientists and translating methods into reliable systems • Daily, load-bearing use of coding agents and a well-developed view of their limitations • Applicants must be authorized to work in the United States • Unable to offer visa sponsorship or transfers • Preferred: livestock, plant, or human population genomics • Preferred: parentage or pedigree work, including SNP-based parentage verification, kinship, or reconciling pedigrees with genotypes • Preferred: production experience with genotype imputation or sequencing pipelines • Preferred: genomic prediction (GBLUP and relatives) • Preferred: LIMS or sample-tracking integration with a wet lab • Preferred: supporting a small team through rapid growth • Preferred: experience at a sequencing lab or genomics service company • Preferred: Terraform/OpenTofu • Agriculture experience is not required

🏖️ Avantages

• Medical coverage • Dental coverage • Vision coverage • 401(k) • Pet insurance • Flexible paid time off • Paid parental leave, including up to twelve weeks of paid leave and/or supplemental pay coordination with applicable state benefits • Equity options • Flexible, remote-friendly work environment • Equal opportunity employer • Reasonable accommodations throughout the application and interview process

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